Научные руководители
 |
Мелешко Дмитрий АлексеевичPhD, философские науки meleshko.dmitrii@itmo.ru Структурное подразделение: передовая инженерная школа ИТМО интердисциплинарного инжиниринга Должность: доцент (квалификационная категория "ординарный доцент") Структурное подразделение: передовая инженерная школа ИТМО интердисциплинарного инжиниринга Должность: научный сотрудник Профиль: 03.02.07 - Генетика Область интересов: Анализ данных NGS Геномная сборка Алгоритмы в биоинформатике Рабочий язык: Английский, Русский |
Публикации руководителя
| Выходные данные | Год | Индексирование в БД |
| Efimova I., Mukhina A., Markova Z., Mordanov S., Soprunova I., Pershin D., Balinova N., Petrusenko Y., Meleshko D., Zinchenko R., Shilova N., Voronin S., Shcherbina A., Kutsev S., Marakhonov A. 13q Deletion Syndrome Presenting with Lymphopenia Detected Through Newborn Screening for Primary Immunodeficiencies//International Journal of Molecular Sciences, 2025, Vol. 26, No. 19, pp. 9302 | 2025 | Scopus, Web of Science, Белый список |
| Kokoulin M.S., Savicheva Y.V., Otstavnykh N.Y., Kurilenko V.V., Meleshko D.A., Isaeva M.P. Structure and Biosynthetic Gene Cluster of Sulfated Capsular Polysaccharide from the Marine Bacterium Vibrio sp. KMM 8419//International Journal of Molecular Sciences, 2024, Vol. 25, No. 23, pp. 12927 | 2024 | Scopus, Web of Science, Белый список |
| Meleshko D., Prjbelski A.D., Raiko M., Tomescu A., Tilgner H., Hajirasouliha I. CLOUDRNASPADES: isoform assembly using bulk barcoded RNA sequencing data//Bioinformatics, 2024, Vol. 40, No. 2, pp. btad781 | 2024 | Scopus, Web of Science, Белый список |
| Mak L., Meleshko D., Danko D., Barakzai W., Maharjan S., Belchikov N., Hajirasouliha I. Ariadne: synthetic long read deconvolution using assembly graphs//Genome Biology, 2023, Vol. 24, No. 1, pp. 197 | 2023 | Scopus, Web of Science, Белый список |
| Popic V., Rohlicek C., Cunial F., Hajirasouliha I., Meleshko D., Garimella K., Maheshwari A. Cue: a deep-learning framework for structural variant discovery and genotyping//Nature Methods, 2023, Vol. 20, No. 4, pp. 559-568 | 2023 | Scopus, Web of Science, Белый список |
| Meleshko D., Korobeynikov A. Benchmarking state-of-the-art approaches for norovirus genome assembly in metagenome sample//Biology, 2023, Vol. 12, No. 8, pp. 1066 | 2023 | Scopus, Web of Science, Белый список |
| Meleshko D., Yang R., Marks P., Williams S., Hajirasouliha I. Efficient detection and assembly of non-reference DNA sequences with synthetic long reads//Nucleic Acids Research, 2022, Vol. 50, No. 18, pp. e108 | 2022 | Scopus, Web of Science, Белый список |
| Edgar R.C., Taylor B., Lin V., Altman T., Barbera P., Meleshko D., Lohr D., Novakovsky G., Buchfink B., Al-Shayeb B., Banfield J., De La Pena M., Korobeynikov A., Chikhi R., Babaian A. Petabase-scale sequence alignment catalyses viral discovery//Nature, 2022, Vol. 602, No. 7895, pp. 142-147 | 2022 | Scopus, Web of Science, Белый список |
| Meleshko D., Hajirasouliha I., Korobeynikov A. coronaSPAdes: from biosynthetic gene clusters to RNA viral assemblies//Bioinformatics, 2022, Vol. 38, No. 1, pp. 1-8 | 2022 | Scopus, Web of Science, Белый список |
| Prjibelski A., Antipov D., Meleshko D., Lapidus A., Korobeynikov A. Using SPAdes de novo assembler//Current Protocols in Bioinformatics, 2020, Vol. 70, No. 1, pp. e102 | 2020 | Scopus |
| Nurk S., Meleshko D., Korobeynikov A., Pevzner P.A. metaSPAdes: a new versatile metagenomic assembler//Genome Research, 2017, Vol. 27, No. 5, pp. 824-834 | 2017 | Scopus, Web of Science |