Научные руководители
 |
Мелешко Дмитрий АлексеевичPhD, философские науки Структурное подразделение: передовая инженерная школа ИТМО интердисциплинарного инжиниринга Должность: доцент (квалификационная категория "ординарный доцент") Структурное подразделение: передовая инженерная школа ИТМО интердисциплинарного инжиниринга Должность: научный сотрудник Профиль: 03.02.07 - Генетика Область интересов: Анализ данных NGS Геномная сборка Алгоритмы в биоинформатике Рабочий язык: Английский, Русский |
Публикации руководителя
| Выходные данные | Год | Индексирование в БД |
| Meleshko D., Prjbelski A.D., Raiko M., Tomescu A., Tilgner H., Hajirasouliha I. CLOUDRNASPADES: isoform assembly using bulk barcoded RNA sequencing data//Bioinformatics, 2024, Vol. 40, No. 2, pp. btad781 | 2024 | Scopus, Web of Science, Белый список |
| Kokoulin M.S., Savicheva Y.V., Otstavnykh N.Y., Kurilenko V.V., Meleshko D.A., Isaeva M.P. Structure and Biosynthetic Gene Cluster of Sulfated Capsular Polysaccharide from the Marine Bacterium Vibrio sp. KMM 8419//International Journal of Molecular Sciences, 2024, Vol. 25, No. 23, pp. 12927 | 2024 | Scopus, Web of Science, Белый список |
| Mak L., Meleshko D., Danko D., Barakzai W., Maharjan S., Belchikov N., Hajirasouliha I. Ariadne: synthetic long read deconvolution using assembly graphs//Genome Biology, 2023, Vol. 24, No. 1, pp. 197 | 2023 | Scopus, Web of Science, Белый список |
| Meleshko D., Korobeynikov A. Benchmarking state-of-the-art approaches for norovirus genome assembly in metagenome sample//Biology, 2023, Vol. 12, No. 8, pp. 1066 | 2023 | Scopus, Web of Science, Белый список |
| Popic V., Rohlicek C., Cunial F., Hajirasouliha I., Meleshko D., Garimella K., Maheshwari A. Cue: a deep-learning framework for structural variant discovery and genotyping//Nature Methods, 2023, Vol. 20, No. 4, pp. 559-568 | 2023 | Scopus, Web of Science, Белый список |
| Meleshko D., Hajirasouliha I., Korobeynikov A. coronaSPAdes: from biosynthetic gene clusters to RNA viral assemblies//Bioinformatics, 2022, Vol. 38, No. 1, pp. 1-8 | 2022 | Scopus, Web of Science |
| Edgar R.C., Taylor B., Lin V., Altman T., Barbera P., Meleshko D., Lohr D., Novakovsky G., Buchfink B., Al-Shayeb B., Banfield J., De La Pena M., Korobeynikov A., Chikhi R., Babaian A. Petabase-scale sequence alignment catalyses viral discovery//Nature, 2022, Vol. 602, No. 7895, pp. 142-147 | 2022 | Scopus, Web of Science |
| Meleshko D., Yang R., Marks P., Williams S., Hajirasouliha I. Efficient detection and assembly of non-reference DNA sequences with synthetic long reads//Nucleic Acids Research, 2022, Vol. 50, No. 18, pp. e108 | 2022 | Scopus, Web of Science |
| Prjibelski A., Antipov D., Meleshko D., Lapidus A., Korobeynikov A. Using SPAdes de novo assembler//Current Protocols in Bioinformatics, 2020, Vol. 70, No. 1, pp. e102 | 2020 | Scopus |
| Nurk S., Meleshko D., Korobeynikov A., Pevzner P.A. metaSPAdes: a new versatile metagenomic assembler//Genome Research, 2017, Vol. 27, No. 5, pp. 824-834 | 2017 | Scopus, Web of Science |