Кошель Елена Ивановна


кандидат биологических наук
koshel@itmo.ru
Структурное подразделение:
лаборатория ДНК-наносенсорной диагностики
Должность:
заведующий лабораторией
Структурное подразделение:
химико-биологический кластер
Должность:
доцент (квалификационная категория "ординарный доцент")
Структурное подразделение:
химико-биологический кластер
Должность:
научный сотрудник
Профиль:
03.02.07 - Генетика
03.01.04 - Биохимия
1.5.4. - Биохимия
1.5.7. - Генетика
2.2.8. - Методы и приборы контроля и диагностики материалов, изделий, веществ и природной среды
05.11.13 - Приборы и методы контроля природной среды, веществ, материалов и изделий

Область интересов:
Микробиология, программирование клеток, антибиотикорезистентность, фармацевтика, нанотехнологии, таргетная терапия, генная инженерия, генетика микроорганизмов, биопленки. Диагностика, микробиом, биоремедиация.
Рабочий язык:
Английский, Русский

Публикации руководителя
Выходные данные Год Индексирование в БД
Shkodenko L.A., Mohamed A., Atie M., Rubel M.S., Koshel E.I. A DAMP-Based Assay for Rapid and Affordable Diagnosis of Bacterial Meningitis Agents: Haemophilus influenzae, Neisseria meningitidis, and Streptococcus pneumoniae//International Journal of Molecular Sciences, 2024, Vol. 25, No. 15, pp. 8282 2024 Scopus, Web of Science, Белый список
Tsvetikova S.A., Zabavkina A.A., Nikonorova V.G., Tsymbal S.A., Dukhinova M.S., Chrishtop V.V., Koshel E.I. Stimulatory Effect on Mice by Bacterial Exopolysaccharide, Colanic Acid//Russian Journal of Bioorganic Chemistry, 2024, Vol. 50, No. 2, pp. 594–603 2024 Scopus, Web of Science, Белый список
Tsvetikova S.A., Koshel E.I. Optimized Protocol for Production and Extraction of Colanic Acid from E. coli Culture//Russian Journal of Bioorganic Chemistry, 2024, Vol. 50, No. 4, pp. 1357–1364 2024 Scopus, Web of Science, Белый список
Dib N., Otinov G.D., Mokhamed A., Gandalipov E.R., Kovtunov E.A., Koshel E.I. E. Coli Nissle 1917 Based Carrier for DNA Delivery into Colorectal Carcinoma Cells//Russian Journal of Bioorganic Chemistry, 2024, Vol. 50, No. 2, pp. 459–466 2024 Scopus, Web of Science, Белый список
Tsvetikova S.A., Zabavkina A.A., Ivankova O., Koshel E.I. Cellular Effects of Enterobacteriaceae Polysaccharide Colanic Acid//International Journal of Molecular Sciences, 2024, Vol. 25, No. 15, pp. 8017 2024 Scopus, Web of Science, Белый список
Rubel M.S., Shkodenko L.V., Gorbenko D.A., Solyanikova V.V., Maltzeva Y.I., Rubel A.A., Koshel E.I., Kolpashchikov D.M. Detection of multiplex NASBA RNA products using colorimetric split G quadruplex probes//Methods in Molecular Biology, 2023, Vol. 2709, pp. 287–298 2023 Scopus, Web of Science, Белый список
Pilipenko I., Murzova A., Savin A., Mohamed A., Vladimirova E., Koshel E., Shamova O., Kumacheva E. Dual-Function Hydrogel Dressings with a Dynamic Exchange of Iron Ions and an Antibiotic Drug for Treatment of Infected Wounds//ACS Applied Bio Materials, 2023, Vol. 6, No. 5, pp. 1896–1905 2023 Scopus, Web of Science, Белый список
Pozdnyakov I.R., Koshel E., Selyuk A.O., Sukhanova X.V. Transfer of culture of a bacterivorous protist Nuclearia thermophila to feeding on monoculture of Escherichia coli//Protistology, 2023, Vol. 17, No. 1, pp. 50-57 2023 Scopus, Белый список, ВАК, РИНЦ
Давидьян А.Г., Кошель Е.И., Галкина С.А., Сайфитдинова А.Ф., Гагинская Е.Р. Функционирование ядрышкового организатора в растущих ооцитах кур: ревизия существующих представлений // Онтогенез -2023. - Т. 54. - № 1. - С. 18-26 2023 RSCI, Белый список, ВАК, РИНЦ
Davidian A.G., Koshel E.I., Galkina S.A., Saifitdinova A.F., Gaginskaya E.R. Nucleolus Organizer Region Functioning in Chicken Growing Oocytes: A Revision of the Existing Views//Russian Journal of Developmental Biology, 2023, Vol. 54, No. 1, pp. 15-23 2023 Web of Science, Белый список
Fakhardo A.F., Anastasova E.I., Makarov V., Ikonnikova E., Kulko E., Agadzhanian N., Yakunina M., Shkodenko L., Tsvetikova S., Toropko M., Koshel E., Zakharov M., Alexandrov G., Khuttunen O., Kulikov P., Burmistrov O., Vinogradov V., Prilepskii A. Heparin-coated iron oxide nanoparticles: application as a liver contrast agent, toxicity and pharmacokinetics//Journal of Materials Chemistry B, 2022, Vol. 10, No. 38, pp. 7797-7807 2022 Scopus, Web of Science
Protasiuk L.E., Serov N.S., Lokteva A.V., Kladko D.V., Koshel E.I., Vinogradov V.V. Mechano-bactericidal anisotropic particles for oral biofilm treatment//Journal of Materials Chemistry B, 2022, Vol. 10, No. 25, pp. 4867-4877 2022 Scopus, Web of Science
Volov A., Shkodenko L., Koshel E., Drozdov A.S. Bio-Inspired Surface Modification of Magnetite Nanoparticles with Dopamine Conjugates//Nanomaterials, 2022, Vol. 12, No. 13, pp. 2230 2022 Scopus, Web of Science
Maltseva E.S., Nikolaeva V.O., Savin A.M., Dobryakov M.Y., Koshel E.I., Krivoshapkin P.V., Krivoshapkina E.F. Fluorescent Hybrid Material Based on Natural Spider Silk and Carbon Dots for Bioapplication//ACS Biomaterials Science and Engineering, 2022, Vol. 8, No. 8, pp. 3310-3319 2022 Scopus, Web of Science
Olunoiki E., Rehner J., Bischoff M., Koshel E., Vogt T., Reichrath J., Becker S.L. Characteristics of the Skin Microbiome in Selected Dermatological Conditions: A Narrative Review//Life, 2022, Vol. 12, No. 9, pp. 1420 2022 Scopus, Web of Science
Falchevskaya A., Prilepskii A.Y., Tsvetikova S.A., Koshel E.I., Vinogradov V.V. Facile Synthesis of a Library of Hollow Metallic Particles through the Galvanic Replacement of Liquid Gallium//Chemistry of Materials, 2021, Vol. 33, No. 5, pp. 1571-1580 2021 Scopus, Web of Science
Davidian A.G., Koshel E.I., Dyomin A.G., Galkina S.A., Saifitdinova A.F., Gaginskaya E.R. On some structural and evolutionary aspects of rDNA amplification in oogenesis of Trachemys scripta turtles//Cell and Tissue Research, 2021, Vol. 383, No. 2, pp. 853-864 2021 Scopus, Web of Science
Румянцева В.И., Кошель Е.И. Актуальная стратегия эрадикации сформированных биопленок при использовании магнитных наноструктур // Современные проблемы биохимии, генетики и биотехнологии: материалы III Всероссийской научной конференции с международным участием (Уфа, 21-23сентября 2021г.) -2021. - С. 174-178 2021 РИНЦ
Rumyantceva V., Rumyantceva V., Andreeva Y., Tsvetikova S., Radaev A., Vishnevskaya M., Vinogradov V., Drozdov A.S., Koshel E. Magnetically controlled carbonate nanocomposite with ciprofloxacin for biofilm eradication//International Journal of Molecular Sciences, 2021, Vol. 22, No. 12, pp. 6187 2021 Scopus, Web of Science
Alikina M., Shkodenko L., Kramarenko A., Chernyshov I., Belyaeva A., Gutsalova A., Krivoshapkina E., Koshel E., Vinogradov A. ClO2-Loaded Aerogels with Biocide Effect//ACS Applied Materials and Interfaces, 2021, Vol. 13, No. 41, pp. 49490–49499 2021 Scopus, Web of Science
Ulasevich S.A., Koshel E.I., Kassirov I.S., Brezhneva N.Y., Shkodenko L., Skorb E.V. Oscillating of physicochemical and biological properties of metal particles on their sonochemical treatment//Materials Science and Engineering C, 2020, Vol. 109, pp. 110458 2020 Scopus, Web of Science
Vasilichin V.A., Tsymbal S.A., Fakhardo A.F., Anastasova E., Marchenko A.S., Shtil A., Vinogradov V.V., Koshel E. Effects of Metal Oxide Nanoparticles on Toll-Like Receptor mRNAs in Human Monocytes//Nanomaterials, 2020, Vol. 10, No. 1, pp. 127 2020 Scopus, Web of Science
Otinov G.D., Lokteva A.V., Petrova A.D., Zinchenko I.V., Isaeva M.V., Kovtunov E.A., Koshel E.I. Positive and Negative Effects of Metal Oxide Nanoparticles on Antibiotic Resistance Genes Transfer//Antibiotics, 2020, Vol. 9, No. 11, pp. 742 2020 Scopus, Web of Science
Shkodenko L., Kassirov I.S., Koshel E.I. Metal Oxide Nanoparticles Against Bacterial Biofilms: Perspectives and Limitations//Microorganisms, 2020, Vol. 8, No. 10, pp. 1545 2020 Scopus, Web of Science
Chekini M., Krivoshapkina E.F., Shkodenko L., Koshel E.I., Shestovskaya M.V., Dukhinova M.S., Kheiri S., Khuu N., Kumacheva E. Nanocolloidal hydrogel with sensing and antibacterial activities governed by iron ion sequestration//Chemistry of Materials, 2020, Vol. 32, No. 23, pp. 10066-10075 2020 Scopus, Web of Science
Kovtunov E.A., Shkodenko L.A., Goncharova E.A., Nedorezova D.D., Sidorenko S., Koshel E.I., Kolpashchikov D.M. Towards Point of Care Diagnostics: Visual Detection of Meningitis Pathogens Directly from Cerebrospinal Fluid//ChemistrySelect, 2020, Vol. 5, No. 46, pp. 14572-14577 2020 Scopus, Web of Science
Герцен А.В., Чаленко К.П., Недорезова Д.Д., Колпащиков Д.М., Кошель Е.И. Разработка стратегии борьбы с антибиотикорезистентными штаммами бактерий на основе использования ДНК - наномашин // Гены и клетки [Genes and Cells] -2020. - Т. 15. - № S3. - С. 184 2020 RSCI, ВАК, РИНЦ
Буланцев Н.А., Комиссаров А.С., Кошель Е.И., Круглов Е.Е., Мякишева Ю.В., Кафтырева Л.А. Метагеномный анализ биоптатов толстой кишки пациентов с язвенным колитом // Гены и клетки [Genes and Cells] -2020. - Т. 15. - № S3. - С. 128 2020 RSCI, ВАК, РИНЦ
Tsvetikova S., Koshel E.I. Microbiota and cancer: host cellular mechanisms activated by gut microbial metabolites//International Journal of Medical Microbiology, 2020, Vol. 310, No. 4, pp. 151425 2020 Scopus, Web of Science
Serov N.S., Darmoroz D., Lokteva A., Chernyshov I., Koshel E., Vinogradov V.V. One-pot synthesis of template-free hollow anisotropic CaCO 3 structures: towards inorganic shape-mimicking drug delivery systems//Chemical Communications, 2020, Vol. 56, No. 80, pp. 11969-11972 2020 Scopus, Web of Science
Solomatina A.I., Baigildin V.A., Zhukovsky D.D., Krupenya D.V., Koshel E.I., Shcheslavskiy V.I., Tunik S., Chelushkin P.S. How to avoid protein aggregation to improve cellular uptake of albumin-based conjugates: towards the rational design of cell-penetrable phosphorescent probes//Colloid and Polymer Science, 2019, Vol. 297, No. 3, pp. 325-337 2019 Scopus, Web of Science
Solovev Y.V., Prilepskii A.Y., Krivoshapkina E.F., Fakhardo A.F., Bryushkova E.A., Kalikina P.A., Koshel E.I., Vinogradov V.V. Sol-gel derived boehmite nanostructures is a versatile nanoplatform for biomedical applications//Scientific Reports, 2019, Vol. 9, pp. 1176 2019 Scopus, Web of Science
Martakov I.S., Torlopov M., Krivoshapkina E.F., Kalikina P.A., Navrotskaya A.G., Koshel E.I., Galkina A., Demin V., Krivoshapkin P.V. Biotemplate synthesis of porous alumina fibers and filters with controlled structure and properties//Journal of the Taiwan Institute of Chemical Engineers, 2019, Vol. 95, pp. 281-289 2019 Scopus, Web of Science
Мисюрина М.А., Ковтунов Е.А., Шкоденко Л.А., Кошель Е.И. Разработка штамма Escherichia coli для доставки челночных векторов в эукариотические клетки // Живые системы - 2019: сборник научных статей -2019. - С. 191-193 2019
Chalenko K.P., Rotkevich M.S., Kolpashchikov D.M., Koshel E.I. Target selection protocol for DNA-machines development//BMC Bioinformatics, 2019, Vol. 20, No. Suppl.1(SI), pp. 516 2019 Scopus, Web of Science
Мисюрина М.А., Кошель Е.И., Ковтунов Е.А., Шкоденко Л.А. Разаботка системы доставки челночных векторов в эукариотические клетки при помощи бактерий // Современные проблемы медицины и естественных наук: сборник статей Международной научной конференции (Йошкар-Ола, 15-19апреля 2019г.) -2019. - № 8. - С. 147 2019 РИНЦ
Fakhardo A.F., Anastasova E.I., Gabdullina S.R., Solovyeva A.S., Saparova V.B., Chrishtop V.V., Koshevaya E.D., Krivoshapkina E.F., Krivoshapkin P.V., Kiselev G.O., Kalikina P.A., Koshel E.I., Shtil A.A., Vinogradov V.V. Toxicity Patterns of Clinically Relevant Metal Oxide Nanoparticles//ACS Applied Bio Materials, 2019, Vol. 2, No. 10, pp. 4427-4435 2019 Scopus, Web of Science
Sopova J.V., Koshel E.I., Belashova T.A., Zadorsky S.P., Sergeeva A.V., Siniukova V.A., Shenfeld A.A., Velizhanina M.E., Volkov K.V., Nizhnikov A.A., Kachkin D.V., Gaginskaya E.R., Galkin A.P. RNA-binding protein FXR1 is presented in rat brain in amyloid form//Scientific Reports, 2019, Vol. 9, No. 1, pp. 18983 2019 Scopus, Web of Science
Volodkina V., Saifitdinova A., Kulak M., Koshel E.I., Galkina S., Gaginskaya E. Organization of zebra finch oocyte nucleus//Biopolymers and Cell, 2019, Vol. 35, No. 3, pp. 241-242 2019 Scopus
Rumyantceva V., Rumyantceva V., Koshel E., Vinogradov V. Biocide-conjugated magnetite nanoparticles as an advanced platform for biofilm treatment//Therapeutic Delivery, 2019, Vol. 10, No. 4, pp. 241-250 2019 Scopus, Web of Science
Koshel E., Kassirov I.S., Rumiantceva V.I., Rumyantceva V.I., Ulasevich S.A., Andreeva I.I., Skorb E.V., Vinogradov V.V. Development of functional nanostructures effective against bacteria biofilms including multidrug resistant bacteria//Инфекция и иммунитет = Infektsiya i immunitet [Russian Journal of infection and immunity], 2018, Vol. 8, No. 4(спецвыпуск), pp. 605 2018 RSCI, ВАК, РИНЦ
Kalikina P.A., Koshel E.I. Effect of metal oxide nanoparticles on the exchange of genetic material between bacteria//Инфекция и иммунитет = Infektsiya i immunitet [Russian Journal of infection and immunity], 2018, Vol. 8, No. 4(спецвыпуск), pp. 604 2018 RSCI, ВАК, РИНЦ
Rumyantceva V.I., Andreeva Y.I., Drozdov A.S., Vinogradov V.V., Koshel E.I. Development of magnetically controlled antibacterial complex effective against biofilms//Инфекция и иммунитет = Infektsiya i immunitet [Russian Journal of infection and immunity], 2018, Vol. 8, No. 4(спецвыпуск), pp. 616 2018 RSCI, ВАК, РИНЦ
Rumyantceva V.I., Koshel E.I. A study of the potential of spider silk use for the development of antibacterial drugs//Инфекция и иммунитет = Infektsiya i immunitet [Russian Journal of infection and immunity], 2018, Vol. 8, No. 4(спецвыпуск), pp. 617 2018 RSCI, ВАК, РИНЦ
Kassirov I.S., Ulasevich S.A., Skorb E.V., Koshel E.I. Sonochemical nanostructuring of antibiotics is a new approach to increasing their effectivness against resistance strain//Инфекция и иммунитет = Infektsiya i immunitet [Russian Journal of infection and immunity], 2018, Vol. 8, No. 4(спецвыпуск), pp. 604 2018 RSCI, ВАК, РИНЦ
Komissarov A.S., Galkina S.A., Koshel E.I., Kulak M.M., Dyomin A.G., O'Brien S.J., Gaginskaya E.R., Saifitdinova A.F. New high copy tandem repeat in the content of the chicken W chromosome//Chromosoma, 2018, Vol. 127, No. 1, pp. 73-83 2018 Scopus, Web of Science
Nikitina A.A., Ulasevich S.A., Kassirov I.S., Bryushkova E.A., Koshel E.I., Skorb E.V. Nanostructured Layer-by-Layer Polyelectrolyte Containers to Switch Biofilm Fluorescence//Bioconjugate Chemistry, 2018, Vol. 29, No. 11, pp. 3793-3799 2018 Scopus, Web of Science
Saifitdinova A.F., Koshel E.I., Galkina S., Vishnevskaya M. Celebrating the Jubilee of Elena Gaginskaya — the founder of the Lampbrushology School in Saint Petersburg University//Biological Communications, 2017, Vol. 62, No. 3, pp. 159-164 2017 Scopus, ВАК, РИНЦ
Давидьян А.Г., Кошель Е.И., Лаврова О.Б., Демин А.Г., Галкина С.А., Сайфитдинова А.Ф., Гагинская Е.Р. Функциональные особенности ядрышкового организатора в растущих ооцитах неполовозрелых самок птиц // Онтогенез -2017. - Т. 48. - № 3. - С. 263–269 2017 ВАК, РИНЦ
Koshel E.I., Chelushkin P.S., Melnikov A.S., Serdobintsev P.Y., Stolbovaia A.Y., Saifitdinova A.F., Shcheslavskiy V.I., Chernyavskiy O., Gaginskaya E.R., Koshevoy I.O., Tunik S.P. Lipophilic phosphorescent gold(I) clusters as selective probes for visualization of lipid droplets by two-photon microscopy//Journal of Photochemistry and Photobiology A: Chemistry, 2017, Vol. 332, pp. 122–130 2017 Scopus, Web of Science
Solomatina A.I., Chelushkin P.S., Krupenya D.V., Podkorytov I.S., Artamonova T.O., Sizov V.V., Melnikov A.S., Gurzhiy V.V., Koshel E.I., Shcheslavskiy V.I., Tunik S.P. Coordination to Imidazole Ring Switches On Phosphorescence of Platinum Cyclometalated Complexes: The Route to Selective Labeling of Peptides and Proteins via Histidine Residues//Bioconjugate Chemistry, 2017, Vol. 28, No. 2, pp. 426-437 2017 Scopus, Web of Science
Davidian A.G., Koshel E.I., Lavrova O.B., Dyomin A.G., Galkina S.A., Saifitdinova A.F., Gaginskaya E.R. Functional Features of the Nucleolar Organizer in Developing Oocytes of Juvenile Birds//Russian Journal of Developmental Biology, 2017, Vol. 48, No. 3, pp. 224–230 2017 Scopus, Web of Science
Galkina S., Fillon V., Saifitdinova A., Daks A., Kulak M., Dyomin A., Koshel E.I., Gaginskaya E.R. Chicken microchromosomes in the lampbrush phase: a cytogenetic description//Cytogenetic and Genome Research, 2017, Vol. 152, No. 1, pp. 46-54 2017 Scopus, Web of Science
Dyomin A., Volodkina V., Galkina S., Saifitdinova A., Koshel E., Gaginskaya E. Evolution of ribosomal internal transcribed spacers in Deuterostomia//Molecular Phylogenetics and Evolution, 2017, Vol. 116, pp. 87-96 2017 Scopus, Web of Science
Сайфитдинова А.Ф., Галкина С.А., Кошель Е.И., Гагинская Е.Р. Роль повторяющихся последовательностей в эволюции половых хромосом у птиц [The role of repetitive sequences in the evolution of sex chromosomes in birds] // Цитология [Tsitologiya] -2016. - Т. 58. - № 5. - С. 393–398 2016 Scopus, ВАК, РИНЦ
Кошель Е.И., Ерошенко Г.А., Анисимова Л.В., Новичкова Л.А., Широков А.А., Буров А.М., Кузнецов О.С., Кутырев В.А. Оценка длительности сохранения штаммов Yersinia pestis в клетках почвенных амеб Acanthamoeba sp. в экспериментальных условиях // Проблемы особо опасных инфекций -2016. - Т. 2. - С. 69-74 2016 ВАК, РИНЦ
Ерошенко Г.А., Кошель Е.И., Поршаков А.М., Князева Т.В., Краснов Я.М., Мокроусова Т.В., Новичкова Л.А., Анисимова Л.В. Характеристика энтомопаразитических нематод блох мелких грызунов // Проблемы особо опасных инфекций -2016. - Т. 3. - С. 32-37 2016 ВАК, РИНЦ
Dyomin A., Galkina S., Saifitdinova A., Koshel E.I., Gaginskaya E. Chicken ribosomal intergenetic spacer structure//Chromosome Research, 2016, Vol. 24, No. Suppl.1, pp. S40-S40 2016 Scopus, Web of Science
Saifitdinova A., Komissarov A.S., Galkina S., Koshel E.I., Kulak M., Demin A., O'Brien S.J., Gaginskaya E. Sex Chromosome Specific Repeats in the Chicken Genome//Chromosome Research, 2016, Vol. 24, No. Suppl.1, pp. 1-48 2016 Scopus, Web of Science
Koshel E.I., Tomashenko O.A., Khlebnikov A.F., Gaginskaya E.R., Saifitdinova A.F., Tunik S.P. A new nuclear heterocyclic fluorescent dye–a promising tool for karyology and cytogenetics//Chromosome Research, 2016, Vol. 24, No. Suppl.1, pp. S29-S30 2016 Scopus, Web of Science
Koshel E., Galkina S., Saifitdinova A., Dyomin A., Deryusheva S., Gaginskaya E. Ribosomal RNA gene functioning in avian oogenesis//Cell and Tissue Research, 2016, Vol. 366, No. 3, pp. 533-542 2016 Scopus, Web of Science
Dyomin A.G., Koshel E.I., Kiselev A.M., Saifitdinova A.F., Galkina S., Fukagawa T., Kostareva A.A., Gaginskaya E.R. Chicken rRNA Gene Cluster Structure//PLoS ONE, 2016, Vol. 11, No. 6, pp. e0157464 2016 Scopus, Web of Science
Koshel' E.I., Anisimova L.V., Novichkova L.A., Vidyaeva N.A., Guseva N.P., Eroshenko G.A., Kutyrev V.V. A Study on the Taxonomy of Soil Amoebas from Caspian Plague Foci Based on an Analysis of Ribosomal Operon Sequences//Russian Journal of Genetics, 2015, Vol. 51, No. 1, pp. 33-38 2015 Scopus, Web of Science
Кошель Е.И., Анисимова Л.В., Новичкова Л.А., Видяева Н.А., Гусева Н.П., Ерошенко Г.А., Кутырев В.В. Определение систематической принадлежности почвенных амеб из очагов чумы Прикаспия на основе анализа участков рибосомного оперона [A study on the taxonomy of soil amoebas from Caspian plague foci based on an analysis of ribosomal operon sequences] // Генетика [Genetika] -2015. - Т. 51. - № 1. - С. 39-45 2015 Scopus, ВАК, РИНЦ
Koshel E.I., Aleshin V.V., Eroshenko G.A., Kutyrev V.V. Phylogenetic analysis of entomoparasitic nematodes, potential control agents of flea populations in natural foci of plague//BioMed Research International, 2014, Vol. 2014, pp. 135218 2014 Scopus, Web of Science