Ульянцев Владимир Игоревич


кандидат технических наук
ulyantsev@itmo.ru
Структурное подразделение:
факультет информационных технологий и программирования
Должность:
доцент (квалификационная категория "доцент практики")
Профиль:
05.13.18 - Математическое моделирование, численные методы и комплексы программ
05.13.11 - Математическое и программное обеспечение вычислительных машин, комплексов и компьютерных сетей
2.3.5. - Математическое и программное обеспечение вычислительных систем, комплексов и компьютерных сетей
1.2.1. - Искусственный интеллект и машинное обучение
1.2.2. - Математическое моделирование, численные методы и комплексы программ
1.2.1 - Искусственный интеллект и машинное обучение

Область интересов:
Дискретная оптимизация. Технологии программирования. Биоинформатика. Машинное обучение. Синтез киберфизичеких систем. Задачи SAT и CSP.
Рабочий язык:
Английский, Русский

Публикации руководителя
Выходные данные Год Индексирование в БД
Zakharevich N.V., Morozov M.D., Kanaeva V.A., Filippov M.S., Zyubko T.I., Ivanov A.B., Ulyantsev V.I., Klimina K.M., Olekhnovich E.I. Systemic metabolic depletion of gut microbiome undermines responsiveness to melanoma immunotherapy//Life Science Alliance, 2024, Vol. 7, No. 5, pp. e202302480 2024 Scopus, Web of Science, Белый список
Noskova E., Abramov N., Iliutkin S., Sidorin A., Dobrynin P.V., Ulyantsev V.I. GADMA2: more efficient and flexible demographic inference from genetic data//GigaScience, 2023, Vol. 12, pp. giad059 2023 Scopus, Web of Science, Белый список
Olekhnovich E.I., Ivanov A.B., Babkina A.A., Sokolov A.A., Ulyantsev V.I., Fedorov D.E., Ilina E.N. Consistent Stool Metagenomic Biomarkers Associated with the Response To Melanoma Immunotherapy//mSystems, 2023, Vol. 8, No. 2 2023 Scopus, Web of Science, Белый список
Khachatryan L., Xiang Y., Ivanov A., Glaab E., Graham G., Granata I., Giordano M., Maddalena L., Piccirillo M., Manipur I., Baruzzo G., Cappellato M., Avot B., Stan A., Battey J., Lo Sasso G., Boue S., Ivanov N.V., Peitsch M.C., Hoeng J., Falquet L., Di Camillo B., Guarracino M., Ulyantsev V., Sierro N., Poussin C. Results and lessons learned from the sbv IMPROVER metagenomics diagnostics for inflammatory bowel disease challenge//Scientific Reports, 2023, Vol. 13, No. 1, pp. 6303 2023 Scopus, Web of Science, Белый список
Ivanova V., Chernevskaya E., Vasiluev P., Ivanov A.B., Tolstoganov I., Shafranskaya D., Ulyantsev V., Korobeynikov A., Razin S.V., Beloborodova N., Ulianov S.V., Tyakht A. Hi-C Metagenomics in the ICU: Exploring Clinically Relevant Features of Gut Microbiome in Chronically Critically Ill Patients//Frontiers in Microbiology, 2022, Vol. 12, pp. 770323 2022 Scopus, Web of Science
Mahmoodpoor A., Verkhogliadov G., Melnikov R., Saranin D., Voroshilov P.M., Sapori D., Haroldson R., Nasibulin A., Ishteev A.R., Ulyantsev V., Makarov S.V., Zakhidov A.A. Ionic Liquid Gating in Perovskite Solar Cells with Fullerene/Carbon Nanotube Collectors//Energy Technology, 2022, Vol. 10, No. 9, pp. 2200485 2022 Scopus, Web of Science
Kaplina A., Zaikova E., Ivanov A.B., Volkova Y., Alkhova T., Nikiforov V., Latypov A., Khavkina M., Fedoseeva T., Pervunina T., Skorobogatova Y., Volkova S., Ulyantsev V., Kalinina O., Sitkin S., Petrova N. Intestinal microbiome changes in an infant with right atrial isomerism and recurrent necrotizing enterocolitis: A case report and review of literature//World Journal of Clinical Cases, 2022, Vol. 10, No. 29, pp. 10583–10599 2022 Scopus, Web of Science
Zvyagintseva D., Sigurdsson H., Kozin V.K., Iorsh I., Shelykh I.A., Ulyantsev V., Kyriienko O. Machine learning of phase transitions in nonlinear polariton lattices//Communications Physics, 2022, Vol. 5, No. 1, pp. 8 2022 Scopus, Web of Science
Chivilikhin D., Zakirzyanov I., Ulyantsev V. BeBoSy: Behavior Examples Meet Bounded Synthesis//IEEE Access, 2021, Vol. 9, pp. 27540-27551 2021 Scopus, Web of Science
Ustimenko N., Baryshnikova K.V., Melnikov R., Kornovan D., Ulyantsev V., Evlyukhin A.B. Light focusing by silicon nanosphere structures under conditions of magnetic dipole and quadrupole resonances//Journal of Physics: Conference Series, 2021, Vol. 2015, No. 1, pp. 012160 2021 Scopus, Web of Science
Olekhnovich E.I., Ivanov A.B., Ulyantsev V.I., Ilina E.N. Separation of donor and recipient microbial diversity allows determination of taxonomic and functional features of gut microbiota restructuring following fecal transplantation//mSystems, 2021, Vol. 6, No. 4, pp. e00811-21 2021 Scopus, Web of Science
Semenov A., Chivilikhin D., Pavlenko A., Otpuschennikov I., Ulyantsev V.I., Ignatiev A. Evaluating the Hardness of SAT Instances Using Evolutionary Optimization Algorithms//Leibniz International Proceedings in Informatics, LIPIcs, 2021, Vol. 210, pp. 47 2021 Scopus, Web of Science
Ustimenko N., Baryshnikova K.V., Melnikov R., Kornovan D.F., Ulyantsev V., Chichkov B., Evlyukhin A.B. Multipole optimization of light focusing by silicon nanosphere structures//Journal of the Optical Society of America B: Optical Physics, 2021, Vol. 38, No. 10, pp. 3009-3019 2021 Scopus, Web of Science
Melnikov R., Baryshnikova K.V., Petrov M.I., Ulyantsev V., Evlyukhin A.B., Chichkov B. Evolutionary and genetic algorithms for design of metadevices working on electric dipole resonance//Journal of Physics: Conference Series, 2020, Vol. 1461, No. 1, pp. 012011 2020 Scopus, Web of Science
Noskova E., Ulyantsev V., Koepfli K., O'Brien S.J., Dobrynin P.V. GADMA: Genetic algorithm for inferring demographic history of multiple populations from allele frequency spectrum data//GigaScience, 2020, Vol. 9, No. 3, pp. giaa005 2020 Scopus, Web of Science
Abdurasulova I., Tarasova E., Matsulevich A., Ivanov A.B., Ulyantsev V., Bisaga G., Negoreeva I., Stoliarov I. Immunomodulating and phychomodulating role of intestinal microbiome in multiple scerosis//Журнал эволюционной биохимии и физиологии [Zhurnal evoliutsionnoi biokhimii i fiziologii], 2020, Vol. 56, No. 7, pp. 727 2020 RSCI, ВАК, РИНЦ
Абдурасулова И.Н., Тарасова Е.А., Серебрякова М.К., Иванов А.Б., Ульянцев В.И., Бисага Г.Н., Ильвес А.Г., Шкильнюк Г.Г., Негореева И.Г., Столяров И.Д., Суворов А.Н. Типы изменений микробиома кишечника при рассеянном склерозе и их связь с особенностями субпопуляционного состава иммунных клеток // Гастроэнтерология Санкт-Петербурга -2020. - № 1-2. - С. 76 2020 РИНЦ
Zhernakova D.A., Brukhin V., Malov S., Oleksyk T., Koepfli K., Zhuk A., Dobrynin P., Klivera S., Cherkasov N., Tamazian G., Rotkevich M., Krasheninnikova K., Evsyukov I., Sidorov S., Gorbunova A., Chernyaeva E., Shevchenko A., Kolchanova S., Komissarov A.S., Simonov S., Antonik A., Logachev A., Polevh D., Pavlovah O., Glotov A., Ulantsev V., Noskova E., Davydova T., Sivtseva T., Limborska S., Balanovsky O., Osakovsky V., Novozhilov A., Puzyrev V., O'Brien S. Genome-wide sequence analyses of ethnic populations across Russia//Genomics, 2020, Vol. 112, No. 1, pp. 442-458 2020 Scopus, Web of Science
Zakirzyanov I., Morgado A., Ignatiev A., Ulyantsev V., Marques-Silva J. Efficient Symmetry Breaking for SAT-Based Minimum DFA Inference//Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics), 2019, Vol. 11417, pp. 159-173 2019 Scopus, Web of Science
Pavlenko A.L., Semenov A., Ulyantsev V. Evolutionary Computation Techniques for Constructing SAT-Based Attacks in Algebraic Cryptanalysis//Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics), 2019, Vol. 11454, pp. 237-253 2019 Scopus, Web of Science
Kazakov S.V., Ulyantsev V.I., Nurk S. Closing gaps in draft genome assemblies using Oxford Nanopore sequencing and Read-Until technology//BMC Bioinformatics, 2019, Vol. 20, No. 17(SI), pp. P4 2019 Scopus, Web of Science
Pavlenko A., Semenov A., Ulyantsev V.I., Zaikin O. Parallel Framework for Evolutionary Black-box Optimization with Application to Algebraic Cryptanalysis//42nd International Convention on Information and Communication Technology, Electronics and Microelectronics (MIPRO), 2019, pp. 1144-1149 2019 Scopus, Web of Science
Pavlenko A., Buzdalov M., Ulyantsev V. Fitness Comparison by Statistical Testing in Construction of SAT-Based Guess-and-Determine Cryptographic Attacks//GECCO 2019 - Proceedings of the 2019 Genetic and Evolutionary Computation Conference Companion, 2019, pp. 312-320 2019 Scopus, Web of Science
Суворов Д.М., Ульянцев В.И. Примеры применения методов синтеза конечных автоматов для генерации моделей смарт-контрактов // СПИСОК-2019 Материалы всероссийской научной конференции по проблемам информатики (СПб, 23-26апреля 2019г.) -2019. - С. 209-214 2019
Chivilikhin D., Ulyantsev V., Shalyto A., Vyatkin V. Function block finite-state model identification using SAT and CSP solvers//IEEE Transactions on Industrial Informatics, 2019, Vol. 15, No. 8, pp. 4558-4568 2019 Scopus, Web of Science
Ulyantsev V.I., Buzhinsky I., Shalyto A.A. Exact finite-state machine identification from scenarios and temporal properties//International Journal on Software Tools for Technology Transfer, 2018, Vol. 20, No. 1, pp. 35-55 2018 Scopus, Web of Science
Ovsiannikova P., Chivilikhin D., Ulyantsev V., Stankevich A., Zakirzyanov I., Vyatkin V., Shalyto A. Active learning of formal plant models for cyber-physical systems//Proceedings of 16th IEEE Interantional Conference on Industrial Informatics, INDIN 2018, 2018, pp. 719-724 2018 Scopus, Web of Science
Chivilikhin D., Buzhinsky I., Ulyantsev V., Stankevich A., Shalyto A., Vyatkin V. Counterexample-guided inference of controller logic from execution traces and temporal formulas//Proceedings of the 23rd IEEE International Conference on Emerging Technologies and Factory Automation (EFTA), 2018, pp. 91-98 2018 Scopus, Web of Science
Zakirzyanov I., Shalyto A., Ulyantsev V. Finding All Minimum-Size DFA Consistent with Given Examples: SAT-Based Approach//Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics), 2018, Vol. 10729, pp. 117-131 2018 Scopus, Web of Science
Olekhnovich E.I., Vasilyev A.T., Ulyantsev V.I., Kostryukova E.S., Tyakht A.V. MetaCherchant: analyzing genomic context of antibiotic resistance genes in gut microbiota//Bioinformatics, 2018, Vol. 34, No. 3, pp. 434-444 2018 Scopus, Web of Science
Avdyukhin D., Chivilikhin D., Korneev G., Ulyantsev V., Shalyto A. Plant Trace Generation for Formal Plant Model Inference: Methods and Case Study//Proceedings of 2017 15th IEEE International Conference on Industrial Informatics (INDIN), 2017, pp. 746-752 2017 Scopus, Web of Science
Ovsiannikova P., Chivilikhin D., Ulyantsev V., Shalyto A. Closed-loop verification of a compensating group drive model using synthesized formal plant model//22nd IEEE International Conference on Emerging Technologies and Factory Automation (ETFA 2017), 2017, pp. 1-4 2017 Scopus, Web of Science
Kachalsky I., Zakirzyanov I., Ulyantsev V. Applying reinforcement learning and supervised learning techniques to play Hearthstone//16th IEEE International Conference on Machine Learning and Applications, ICMLA-2017, 2017, pp. 1145-1148 2017 Scopus, Web of Science
Chivilikhin D., Ulyantsev V., Shalyto A., Vyatkin V. CSP-based Inference of Function Block Finite-State Models from Execution Traces//Proceedings of 2017 15th IEEE International Conference on Industrial Informatics (INDIN), 2017, pp. 714-719 2017 Scopus, Web of Science
Чивилихин Д.С., Ульянцев В.И., Шалыто А.А. Модифицированный муравьиный алгоритм для построения конечных автоматов по сценариям работы и темпоральным формулам // Автоматика и телемеханика -2016. - № 3. - С. 137-151 2016 ВАК, РИНЦ
Chivilikhin D.S., Ulyantsev V.I., Shalyto A.A. Modified ant colony algorithm for constructing finite state machines from execution scenarios and temporal formulas//Automation and Remote Control, 2016, Vol. 77, No. 3, pp. 473-484 2016 Scopus, Web of Science
Dubinkina V.B., Ischenko D.S., Ulyantsev V.I., Tyakht A.V., Alexeev D.G. Assessment of k-mer spectrum applicability for metagenomic dissimilarity analysis//BMC Bioinformatics, 2016, Vol. 17, No. 1, pp. 38 2016 Scopus, Web of Science
Ulyantsev V.I., Kazakov S.V., Dubinkina V.B., Tyakht A.V., Alexeev D.G. MetaFast: fast reference-free graph-based comparison of shotgun metagenomic data//Bioinformatics, 2016, Vol. 32, No. 18, pp. 2760-2767 2016 Scopus, Web of Science
Бужинский И.П., Казаков С.В., Ульянцев В.И., Царев Ф.Н., Шалыто А.А. Модификация метода генерации управляющих конечных автоматов с непрерывными воздействиями по обучающим примерам // Известия Российской академии наук. Теория и системы управления -2015. - № 6. - С. 17-30 2015 ВАК, РИНЦ
Buzhinskii I.P., Kazakov S.V., Ulyantsev V.I., Tsarev F.N., Shalyto A.A. Modification of the method of generation of control finite-state machines with continuous actions based on training examples//Journal of Computer and Systems Sciences International, 2015, Vol. 54, No. 6, pp. 853-865 2015 Scopus, Web of Science
Ulyantsev V., Melnik M. Constructing Parsimonious Hybridization Networks from Multiple Phylogenetic Trees Using a SAT-Solver//Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics), 2015, Vol. 9199, pp. 141-153 2015 Scopus, Web of Science
Buzhinsky I.P., Ulyantsev V.I., Veijalainen J., Viatkin V.V. Evolutionary Approach to Coverage Testing of IEC 61499 Function Block Applications//Proceeding - 2015 IEEE International Conference on Industrial Informatics, INDIN 2015, 2015, pp. 1213-1218 2015 Scopus, Web of Science
Ulyantsev V., Zakirzyanov I., Shalyto A. BFS-Based Symmetry Breaking Predicates for DFA Identification//Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics), 2015, Vol. 8977, pp. 611-622 2015 Scopus, Web of Science
Chivilikhin D., Ulyantsev V. Inferring Automata-Based Programs from Specification With Mutation-Based Ant Colony Optimization//GECCO 2014 - Companion Publication of the 2014 Genetic and Evolutionary Computation Conference, 2014, pp. 67-68 2014 Scopus
Buzhinsky I.P., Ulyantsev V.I., Chivilikhin D.S., Shalyto A.A. Inducing finite state machines from training samples using ant colony optimization//Journal of Computer and Systems Sciences International, 2014, Vol. 53, No. 2, pp. 256-266 2014 Scopus, Web of Science
Buzhinsky I., Chivilikhin D., Ulyantsev V., Tsarev F. Improving the Quality of Supervised Finite-State Machine Construction Using Real-Valued Variables//GECCO 2014 - Companion Publication of the 2014 Genetic and Evolutionary Computation Conference, 2014, pp. 1037-1040 2014 Scopus
Бужинский И.П., Ульянцев В.И., Чивилихин Д.С., Шалыто А.А. Генерация управляющих автоматов по обучающим примерам на основе муравьиного алгоритма // Известия Российской академии наук. Теория и системы управления -2014. - № 2. - С. 111-121 2014 ВАК, РИНЦ
Чивилихин Д.С., Ульянцев В.И., Шалыто А.А. Муравьиный алгоритм для построения автоматных программ по спецификации // XII Всероссийское совещание по проблемам управления ВСПУ-2014 (Москва, 16-19июля 2014г.) -2014. - С. 4351-4542 2014 РИНЦ
Ведерников Н.В., Демьянюк В.Ю., Кротков П.А., Ульянцев В.И., Шалыто А.А. Применение методов машинного обучения для автоматизированного построения управляющих автоматов в высокоуровневых средствах проектирования систем // XII Всероссийское совещание по проблемам управления ВСПУ-2014 (Москва, 16-19июля 2014г.) -2014. - С. 3159-3166 2014 РИНЦ
Чивилихин Д.С., Ульянцев В.И., Вяткин В.В., Шалыто А.А. Построение автоматных программ по спецификации с помощью муравьиного алгоритма на основе графа мутаций // Научно-технический вестник информационных технологий, механики и оптики [Scientific and Technical Journal of Information Technologies, Mechanics and Optics] -2014. - № 6(94). - С. 98-105 2014 ВАК, РИНЦ
Chivilikhin D., Ulyantsev V., Shalyto A. Combining Exact and Metaheuristic Techniques for Learning Extended Finite-State Machines from Test Scenarios and Temporal Properties//Proceedings - 2014 13th International Conference on Machine Learning and Applications, ICMLA 2014, 2014, pp. 350-355 2014 Scopus, Web of Science
Chivilikhin D.S., Ulyantsev V.I., Shalyto A.A. Extended Finite-State Machine Inference With Parallel Ant Colony Based Algorithms//Proceedings of the Student Workshop on Bioinspired Optimization Methods and their Applications, BIOMA 2014, 2014, pp. 117-126 2014 Scopus
Шовкопляс Г.Ф., Ульянцев В.И. Готовимся к олимпиадам по информатике. Задача «Починка забора» // Компьютерные инструменты в школе -2014. - № 1. - С. 22-25 2014
Яковлева Д.В., Ульянцев В.И. Готовимся к олимпиадам по информатике. Задача «НОД И НОК» // Компьютерные инструменты в школе -2014. - № 2. - С. 30-33 2014
Ульянцев В.И., Панченко Е.В. Применение методов решения задачи о выполнимости квантифицированной булевой функции для построения управляющих конечных автоматов по сценариям работы и темпоральным свойствам // Научно-технический вестник информационных технологий, механики и оптики [Scientific and Technical Journal of Information Technologies, Mechanics and Optics] -2013. - № 4(86). - С. 151-153 2013 ВАК, РИНЦ
Ведерников Н.В., Замятин Е.И., Шовкопляс Г.Ф., Ульянцев В.И. Готовимся к олимпиадам по информатике. Задача «Штурм» // Компьютерные инструменты в школе -2013. - № 6. - С. 28–31 2013
Buzhinsky I.P., Ulyantsev V.I., Shalyto A.A. Test-based induction of finite-state machines with continuous output actions//IFAC Proceedings Volumes (IFAC-PapersOnline), 2013, Vol. 9, No. 1, pp. 1049-1054 2013 Scopus
Chivilikhin D.S., Ulyantsev V.I., Shalyto A.A. Solving five instances of the artificial ant problem with ant colony optimization//IFAC Proceedings Volumes (IFAC-PapersOnline), 2013, Vol. 9, No. 1, pp. 1043-1048 2013 Scopus
Chivilikhin D.S., Ulyantsev V.I. Learning Finite-State Machines: Conserving Fitness Function Evaluations by Marking Used Transitions//Proceedings - 2013 12th International Conference on Machine Learning and Applications, ICMLA 2013, 2013, Vol. 2, pp. 90-95 2013 Scopus, Web of Science
Buzhinsky I.P., Ulyantsev V.I., Tsarev F.N., Shalyto A.A. Search-based construction of finite-state machines with real-valued actions: New representation model//GECCO 2013 - Proceedings of the 2013 Genetic and Evolutionary Computation Conference, 2013, pp. 199-200 2013 Scopus, Web of Science
Замятин Е.И., Филиппов Д.С., Ведерников Н.В., Ульянцев В.И. Задача «Бутерброд для Симбы» // Компьютерные инструменты в школе -2013. - № 5. - С. 44–46 2013
Chivilikhin D.S., Ulyantsev V.I. MuACOsm - A New Mutation-Based Ant Colony Optimization Algorithm for Learning Finite-State Machines//GECCO 2013 - Proceedings of the 2013 Genetic and Evolutionary Computation Conference, 2013, pp. 511-518 2013 Scopus, Web of Science
Chivilikhin D., Ulyantsev V. Learning finite-state machines with classical and mutation-based ant colony optimization: Experimental evaluation//Proceedings of the 1st BRICS Countries Congress on Computational Intelligence, BRICS-CCI 2013, 2013, pp. 528-533 2013 Scopus, Web of Science
Ульянцев В.И., Царев Ф.Н. Применение методов решения задачи о выполнимости булевой формулы для построения управляющих конечных автоматов по сценариям работы // Научно-технический вестник информационных технологий, механики и оптики [Scientific and Technical Journal of Information Technologies, Mechanics and Optics] -2012. - № 1(77). - С. 96-100 2012 ВАК, РИНЦ
Бужинский И.П., Ульянцев В.И. Применение муравьиных алгоритмов для построения автоматов управления системами со сложным поведением на основе обучающих примеров // Международная конференция по мягким вычислениям и измерениям -2012. - Т. 1. - С. 250-253 2012 РИНЦ
Chivilikhin D.S., Ulyantsev V.I. Learning Finite-State Machines with Ant Colony Optimization//Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics), 2012, Vol. 7461, No. LNCS, pp. 268-275 2012 Scopus, Web of Science
Ulyantsev V.I., Tsarev F.N. Extended Finite-State Machine Induction using SAT-Solver//IFAC Proceedings Volumes (IFAC-PapersOnline), 2012, Vol. 14, No. 1, pp. 236-241 2012 Scopus
Chivilikhin D.S., Ulyantsev V.I., Tsarev F.N. Test-Based Extended Finite-State Machines Induction with Evolutionary Algorithms and Ant Colony Optimization//GECCO 2012 Proceedings of the 14th annual conference companion on Genetic and evolutionary computation, 2012, pp. 603-606 2012 Scopus, Web of Science
Чивилихин Д.С., Ульянцев В.И. Метод построения конечных автоматов на основе муравьиных алгоритмов // Научно-технический вестник информационных технологий, механики и оптики [Scientific and Technical Journal of Information Technologies, Mechanics and Optics] -2012. - № 6(82). - С. 72-76 2012 ВАК, РИНЦ
Uliantcev V.I., Tsarev F.N. Extended Finite-State Machine Induction using SAT-Solver//Proceedings - 10th International Conference on Machine Learning and Applications, ICMLA 2011, 2011, Vol. 2, pp. 346–349 2011 Scopus
Ведерников Н.В., Кротков П.А., Ульянцев В.И. Задача "Хвост графа" // Компьютерные инструменты в школе -2011. - № 6. - С. 53-56 2011